دانشگاه علوم پزشکی کردستان (به کردی:زانستگای پزیشکی کوردستان) در سال ۱۳۶۵ به عنوان مجموعه آموزشی پژوهشی سازمان منطقهای بهداشت و درمان استان کردستان تأسیس شد.
برنامههای آموزشی این دانشگاه از ابتدا تحت عنوان آموزشکده پزشکی و پیراپزشکی از آبان و بهمن ماه سال ۱۳۶۵ با پذیرش ۷۶ نفر دانشجو در رشته کاردانی (۴۴ نفر علوم آزمایشگاهی و۳۲ نفر پرستاری) شروع و متعاقب آن در مهرماه و بهمن ماه سال ۱۳۶۶ تعداد ۶۶نفر دانشجو شامل (۲۸ نفر کاردان علوم آزمایشگاهی و۳۸ نفر کارشناس پرستاری) پذیرفته شدند و این روند با پذیرش دانشجو در رشته کاردانی مامائی علاوه بر رشتههای یادشده ادامه یافت. در سال تحصیلی ۱۳۷۰–۱۳۷۱ آموزش رشته پزشکی و رشتههای پیراپزشکی در مقطع کاردانی (شامل بهداشت خانواده، مبارزه با بیماریها، بهداشت محیط) نیز اضافه گردید که دانشجویان رشته پزشکی سهمیه این استان در دانشگاههای علوم پزشکی (اصفهان، ایران و زنجان) و دانشکده علوم پزشکی قزوین به تحصیل مشغول بودند که در سال ۱۳۶۸ با همت مسئولین وزارت متبوع و با تأسیس و ایجاد دانشکده علوم پزشکی در استان موافقت گردید و متعاقب آن در مردادماه سال ۱۳۷۱ به دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی ارتقاء یافت.